臨近分配，他在畢業(yè)分配志愿書上填寫“清華大學”“研究院”“研究生”，學校做出的推薦意見也是“宜于做研究”。按照他自己的想法，這些去向都有助于其深化理論物理研究。然而，當宣布結(jié)果時，他卻被分配到中國科學院應用物理研究所，這完全出乎他的意料。因為無法從事自己喜愛的理論物理研究，高伯龍產(chǎn)生了巨大的心理落差。他幾次協(xié)調(diào)想調(diào)到近代物理研究所都沒有成功，只能把精力用在深厚物理理論基礎(chǔ)上。

恰在這時，中國人民解放軍軍事工程學院（簡稱“哈軍工”）成立，從全國選調(diào)高水平教師，雖然高伯龍并不主動，但選調(diào)人員還是因其業(yè)務水平過硬一下子就看中了他。高伯龍到“哈軍工”后從事物理教學，那里學生特別喜歡提問，對此有些教員很怕學生提問答不出，但高伯龍是有問必答，在學生中漸漸出了名，都說來了個“厲害老師”。雖然如此，高伯龍還是想離開，而中科院一直是他心目中從事理論物理研究的理想之地。

1956年中科院招收研究生的時候，高伯龍興奮地報名參考。而當時“哈軍工”迫切需要像高伯龍這樣的高水平教師，如果他讀研離去對學院教學工作將是一大損失，于是不同意他報考。性格倔強的高伯龍就自己偷偷前往北京應試，結(jié)果以考分第一名的身份被中科院錄取。高伯龍自己拿著行李就去報到，被“哈軍工”領(lǐng)導知道后，連夜派人追到北京把他“押”了回來。后來“哈軍工”派人找到中科院領(lǐng)導協(xié)調(diào)，說“哈軍工”急需人才，中科院不能從這里挖人。同時，哈軍工首任院長陳賡大將親自出面做高伯龍工作，高伯龍讀研最終沒有成行。但回中科院從事心愛的理論物理研究這種想法高伯龍持續(xù)了有20年，卻始終未能如愿。

1975年，全國高校下發(fā)通知，撤銷基礎(chǔ)課部。7月，高伯龍和其他6名物理教研室的教員被分派到激光研究室。初聞此信，高伯龍很是想不通：理論物理是他的摯愛，從事物理基礎(chǔ)課教學有利于研究理論物理，而理論物理研究則會反哺物理基礎(chǔ)課教學。因此，他不想離開物理教研室，沒有實現(xiàn)后又想在物理實驗室留守，最終也未能實現(xiàn)。

經(jīng)過半生坎坷經(jīng)歷，高伯龍深深意識到，一個人的主觀想法必須跟客觀實際相符合，個人志愿不能凌駕于國家需求之上，真正的愛國應該是把自己的前途命運與國家利益密切結(jié)合，應該符合國家的需要。既然組織已經(jīng)把他分到這個崗位、需要他干這個工作，如果還總想著另外一種工作，這必然引起主觀跟客觀的矛盾。用他自己的話說就是“明明生活在高山上，卻不想學爬山而想學游泳，這樣具有根本性的缺陷”。也正是從那時起，他自覺將個人追求毫不猶豫地標定在祖國的需要上！

幾十年后，當我與高老交流，他回憶起那段經(jīng)歷，深有感慨地說：“搞激光，對希望從事理論物理研究的我來說，也許是個損失，更是我事業(yè)上一次艱難的選擇。雖然這一選擇異常艱難，但我最終還是邁出了具有決定意義的一步?！?/p>