美國(guó)波士頓，2016年11月1日晚，扣人心弦的“國(guó)際遺傳工程機(jī)器大賽”頒獎(jiǎng)直播，牽動(dòng)著全球五大洲30多個(gè)國(guó)家、地區(qū)的283支參賽隊(duì)伍，當(dāng)TMMU-China（第三軍醫(yī)大學(xué)-中國(guó)）出現(xiàn)在金獎(jiǎng)名單時(shí)，引發(fā)了一陣歡呼。這場(chǎng)為期5天的合成生物學(xué)領(lǐng)域頂尖賽事，聚集了哈佛大學(xué)、耶魯大學(xué)、斯坦福大學(xué)、麻省理工學(xué)院、劍橋大學(xué)等世界名校，以及北京大學(xué)、清華大學(xué)、中國(guó)科大、復(fù)旦大學(xué)、浙江大學(xué)等國(guó)內(nèi)高校代表隊(duì)。其中，第三軍醫(yī)大學(xué)是我軍2個(gè)斬獲金獎(jiǎng)的院校之一，也是重慶市第一支獲此殊榮的高校參賽隊(duì)。
國(guó)際遺傳工程機(jī)器大賽（iGEM)，由麻省理工學(xué)院于2003年創(chuàng)辦，2005年發(fā)展為國(guó)際性學(xué)術(shù)競(jìng)賽，是合成生物學(xué)領(lǐng)域的頂級(jí)國(guó)際性學(xué)術(shù)競(jìng)賽。合成生物學(xué)是近年來新興研究領(lǐng)域，試圖設(shè)計(jì)、構(gòu)建和完善人工生物模塊、系統(tǒng)，實(shí)現(xiàn)對(duì)復(fù)雜生物系統(tǒng)的操縱和測(cè)量，在多個(gè)領(lǐng)域具有極好的應(yīng)用前景，包括更有效的疫苗生產(chǎn)、藥物研發(fā)，以生物學(xué)為基礎(chǔ)的工業(yè)制造、可再生能源生產(chǎn)、環(huán)境污染的生物治理、生物傳感器對(duì)有毒化學(xué)物質(zhì)的檢測(cè)等，受到學(xué)術(shù)界和工業(yè)界的廣泛關(guān)注。
“曾有人評(píng)價(jià)，合成生物學(xué)是21世紀(jì)與人工智能、腦科學(xué)等并列的顛覆性領(lǐng)域。作為一門新興的交叉學(xué)科，需要這樣的比賽將我們的本科生培養(yǎng)為未來的接班人?！钡谌娽t(yī)大學(xué)領(lǐng)隊(duì)胡啟文副教授說。
在長(zhǎng)期推行“本科生進(jìn)實(shí)驗(yàn)室”的第三軍醫(yī)大學(xué)，參賽項(xiàng)目的社會(huì)價(jià)值或許遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于比賽本身的結(jié)果。
“我們把一個(gè)活的生命體或者細(xì)胞命名為‘底盤生物’，以此為基礎(chǔ)，將其他的一些生物工程系統(tǒng)加諸到這種‘底盤生物’上，使之呈現(xiàn)出多種性能。這就好比在汽車生產(chǎn)中，汽車的車架就是底盤，可以根據(jù)汽車底盤的性狀來安裝不同系統(tǒng)和零部件，最終打造出諸如奔馳、寶馬等不同品牌的汽車。事實(shí)上，對(duì)‘底盤生物’的改造主要包括兩種策略：一種是使它能加載更多的‘東西’，另一種是植入某些‘元素’讓‘底盤生物’運(yùn)行更加高效。后者正是我們此次參賽項(xiàng)目設(shè)計(jì)的基本思路?！钡谌娽t(yī)大學(xué)基礎(chǔ)部微生物學(xué)教研室主任饒賢才教授說。
從2015年年底開始，第三軍醫(yī)大學(xué)的21名本科生在微生物學(xué)教研室等抽調(diào)的指導(dǎo)教師團(tuán)隊(duì)幫帶下，歷時(shí)一年完成了參賽項(xiàng)目。該項(xiàng)目利用食品級(jí)篩選標(biāo)記，對(duì)乳酸乳球菌進(jìn)行遺傳工程改造，構(gòu)建了“外源基因敲入乳酸乳球菌快速篩選系統(tǒng)”，利用篩選標(biāo)記調(diào)控基因?qū)ο到y(tǒng)進(jìn)行了耐受性升級(jí)，通過引導(dǎo)肽、錨定分子等合成生物學(xué)設(shè)計(jì)，準(zhǔn)確穩(wěn)定地將降鈣素展示于乳酸乳球菌表面，并將傷寒沙門菌Vi抗原合成基因簇作為部件，采用快速篩選系統(tǒng)整體植入乳酸乳球菌，得到Vi抗原產(chǎn)生工程菌。
“合成生物學(xué)常用的‘底盤生物’包括大腸桿菌、酵母菌、噬菌體等。我們?cè)趨①愴?xiàng)目中選取的‘底盤生物’乳酸乳球菌，就是乳酸菌的一種，這是一種食品安全級(jí)的菌，很早就被用于發(fā)酵工業(yè)，比如奶酪。與傳統(tǒng)的‘底盤生物’相比，它的優(yōu)勢(shì)非常明顯，但目前對(duì)乳酸乳球菌的研究卻很少。要對(duì)乳酸乳球菌進(jìn)行改造并運(yùn)用到食品和生產(chǎn)中，需要解決很多問題?！钡谌娽t(yī)大學(xué)領(lǐng)隊(duì)胡曉梅教授說。
“通過我們?cè)趯?shí)驗(yàn)室的‘加工’，使得乳酸乳球菌在適當(dāng)培養(yǎng)基上呈現(xiàn)藍(lán)色，而成功植入外源系統(tǒng)的有用工程菌則是白色，這種差別一目了然，為科學(xué)家提供了一種有用而高效的菌種。通過一套設(shè)計(jì)來優(yōu)化乳酸乳球菌，讓乳酸乳球菌真正變成一個(gè)便利的底盤生物。”第三軍醫(yī)大學(xué)參賽隊(duì)隊(duì)長(zhǎng)、本科學(xué)員黃志剛說。
“前期實(shí)驗(yàn)部分要求我們投入大量的時(shí)間去完成，每天除了上課，我們基本就是在實(shí)驗(yàn)室，有時(shí)利用課間10分鐘都要去實(shí)驗(yàn)室看一下菌群生長(zhǎng)情況。經(jīng)過三個(gè)月攻關(guān)，課題才基本有了雛形?！眳①愱?duì)員盧毅飛說。
“項(xiàng)目創(chuàng)新的基礎(chǔ)，來自導(dǎo)師傳授的實(shí)驗(yàn)技能和分子生物學(xué)理論基礎(chǔ)。”參賽隊(duì)員鄧杰忠說。
“大賽包括實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目、實(shí)踐推廣、數(shù)學(xué)建模、合作交流、網(wǎng)頁制作、部件遞交、現(xiàn)場(chǎng)答辯、海報(bào)展示等八個(gè)模塊，需要我們具備實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、數(shù)學(xué)建模、網(wǎng)頁設(shè)計(jì)等綜合技能，對(duì)本科生科研素質(zhì)是重大考驗(yàn)?！眳①愱?duì)員晉旭銳說。
據(jù)悉，該項(xiàng)目準(zhǔn)確把握了益生菌與人類健康這一重大課題，建立了快速無抗生素基因的整合篩選系統(tǒng)，為發(fā)展合成生物學(xué)提供了有效途徑，具有廣闊的發(fā)展前景?！拔覀円矐?yīng)用該優(yōu)化‘底盤生物’，成功構(gòu)建了降鈣素展示菌，人類服用展示了降鈣素的乳酸乳球菌，有望治療骨質(zhì)疏松等骨關(guān)節(jié)疾病。而進(jìn)一步植入其他系統(tǒng)的乳酸乳球工程菌，臨床應(yīng)用更加廣泛?！别堎t才教授介紹道。
